Nombre de dominio completamente calificado—la dirección completa de un host en internet, desde la etiqueta más a la izquierda hasta la raíz. Ejemplo: mail.bunkerdomains.com. (No solo bunkerdomains.com; eso es incompleto si estás enrutando correo o apuntando un servicio a un subdominio específico.)
FQDN importa porque los resolutores DNS necesitan toda la cadena para funcionar correctamente. Cuando registras un dominio, posees la parte de segundo nivel (bunkerdomains); los subdominios son tuyos para crear y apuntar donde quieras mediante registros A, AAAA, CNAME o MX. Un FQDN incluye todo.
Por qué te importa: si estás ejecutando un servidor de correo, endpoint VPN o servicio oculto, necesitas saber el FQDN exacto que publicas en DNS. Mala configuración—como publicar un dominio sin calificar en lugar del FQDN completo—rompe entrega de correo, validación de certificados TLS y descubrimiento de servicios. También relevante si configuras DNS inverso (los registros PTR apuntan a FQDNs, no a nombres parciales).
Relacionado con TTL, archivos de zona y arquitectura DNS en general. Si estás registrando anónimamente y auto-alojando, estarás gestionando FQDNs directamente en tu configuración de nameserver.